MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori PeCan4 chromosome

Total Repeats: 34093

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014555	GAGC	2	8	28	35	25 %	0 %	50 %	25 %	308182189
2	NC_014555	CATT	2	8	114	121	25 %	50 %	0 %	25 %	308182189
3	NC_014555	GAT	3	9	122	130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182189
4	NC_014555	TG	3	6	138	143	0 %	50 %	50 %	0 %	308182189
5	NC_014555	TTCT	2	8	259	266	0 %	75 %	0 %	25 %	308182189
6	NC_014555	GTT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182189
7	NC_014555	T	7	7	318	324	0 %	100 %	0 %	0 %	308182189
8	NC_014555	T	7	7	346	352	0 %	100 %	0 %	0 %	308182189
9	NC_014555	TTC	2	6	356	361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182189
10	NC_014555	ACA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308182189
11	NC_014555	C	6	6	400	405	0 %	0 %	0 %	100 %	308182189
12	NC_014555	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182190
13	NC_014555	C	6	6	642	647	0 %	0 %	0 %	100 %	308182190
14	NC_014555	CT	3	6	691	696	0 %	50 %	0 %	50 %	308182190
15	NC_014555	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182190
16	NC_014555	TCTG	2	8	810	817	0 %	50 %	25 %	25 %	308182190
17	NC_014555	TGA	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182190
18	NC_014555	AAAT	2	8	912	919	75 %	25 %	0 %	0 %	308182191
19	NC_014555	GCC	2	6	1048	1053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308182191
20	NC_014555	ACT	2	6	1189	1194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182191
21	NC_014555	GCT	2	6	1212	1217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182191
22	NC_014555	CA	3	6	1226	1231	50 %	0 %	0 %	50 %	308182191
23	NC_014555	TC	3	6	1285	1290	0 %	50 %	0 %	50 %	308182191
24	NC_014555	T	6	6	1347	1352	0 %	100 %	0 %	0 %	308182191
25	NC_014555	GGC	2	6	1403	1408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308182191
26	NC_014555	GCTT	2	8	1455	1462	0 %	50 %	25 %	25 %	308182191
27	NC_014555	CT	3	6	1561	1566	0 %	50 %	0 %	50 %	308182191
28	NC_014555	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	308182191
29	NC_014555	GTT	2	6	1623	1628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182191
30	NC_014555	CTT	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182191
31	NC_014555	T	6	6	1717	1722	0 %	100 %	0 %	0 %	308182191
32	NC_014555	TTC	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182192
33	NC_014555	A	7	7	1777	1783	100 %	0 %	0 %	0 %	308182192
34	NC_014555	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	308182192
35	NC_014555	CCTG	2	8	1810	1817	0 %	25 %	25 %	50 %	308182192
36	NC_014555	CCAA	2	8	1834	1841	50 %	0 %	0 %	50 %	308182192
37	NC_014555	CAC	2	6	1861	1866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308182192
38	NC_014555	TCTT	2	8	1867	1874	0 %	75 %	0 %	25 %	308182192
39	NC_014555	GTT	2	6	1897	1902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182192
40	NC_014555	T	6	6	1976	1981	0 %	100 %	0 %	0 %	308182192
41	NC_014555	CTT	2	6	1986	1991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182192
42	NC_014555	TGG	2	6	2043	2048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308182192
43	NC_014555	TCA	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182192
44	NC_014555	TTAA	2	8	2057	2064	50 %	50 %	0 %	0 %	308182192
45	NC_014555	AAT	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182192
46	NC_014555	TAG	2	6	2157	2162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182192
47	NC_014555	G	6	6	2189	2194	0 %	0 %	100 %	0 %	308182192
48	NC_014555	ATTC	2	8	2349	2356	25 %	50 %	0 %	25 %	308182192
49	NC_014555	A	8	8	2540	2547	100 %	0 %	0 %	0 %	308182193
50	NC_014555	T	7	7	2636	2642	0 %	100 %	0 %	0 %	308182193
51	NC_014555	T	7	7	2678	2684	0 %	100 %	0 %	0 %	308182193
52	NC_014555	AGC	2	6	2776	2781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308182193
53	NC_014555	GC	3	6	2789	2794	0 %	0 %	50 %	50 %	308182193
54	NC_014555	A	6	6	2827	2832	100 %	0 %	0 %	0 %	308182193
55	NC_014555	AG	3	6	2946	2951	50 %	0 %	50 %	0 %	308182193
56	NC_014555	GTG	2	6	2965	2970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308182193
57	NC_014555	T	6	6	3018	3023	0 %	100 %	0 %	0 %	308182193
58	NC_014555	AGA	2	6	3063	3068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308182193
59	NC_014555	CAAA	2	8	3099	3106	75 %	0 %	0 %	25 %	308182193
60	NC_014555	GTG	2	6	3124	3129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308182193
61	NC_014555	GCC	2	6	3131	3136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308182193
62	NC_014555	GAAA	2	8	3246	3253	75 %	0 %	25 %	0 %	308182194
63	NC_014555	GAAA	2	8	3321	3328	75 %	0 %	25 %	0 %	308182194
64	NC_014555	TG	3	6	3428	3433	0 %	50 %	50 %	0 %	308182194
65	NC_014555	GTT	2	6	3577	3582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182194
66	NC_014555	CTA	2	6	3617	3622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182194
67	NC_014555	A	6	6	3637	3642	100 %	0 %	0 %	0 %	308182194
68	NC_014555	ATC	2	6	3661	3666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182194
69	NC_014555	GC	3	6	3721	3726	0 %	0 %	50 %	50 %	308182194
70	NC_014555	CAAG	2	8	3822	3829	50 %	0 %	25 %	25 %	308182194
71	NC_014555	A	6	6	3865	3870	100 %	0 %	0 %	0 %	308182194
72	NC_014555	ATT	2	6	3905	3910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182194
73	NC_014555	GGC	2	6	3978	3983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308182194
74	NC_014555	GGT	2	6	4084	4089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014555	TAT	2	6	4132	4137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014555	TGG	2	6	4176	4181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014555	ATGC	2	8	4280	4287	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_014555	TGG	2	6	4296	4301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014555	GTG	2	6	4412	4417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014555	ACC	2	6	4444	4449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_014555	GGT	2	6	4457	4462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014555	A	7	7	4578	4584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014555	T	8	8	4598	4605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014555	AAT	2	6	4619	4624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014555	TAAA	2	8	4687	4694	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014555	T	6	6	4762	4767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014555	ATT	2	6	4808	4813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014555	T	7	7	4826	4832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014555	A	6	6	4852	4857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014555	TGT	2	6	4891	4896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014555	TTTTA	2	10	4915	4924	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014555	TC	3	6	4960	4965	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_014555	A	7	7	4992	4998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014555	A	7	7	5007	5013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014555	GCTT	2	8	5205	5212	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_014555	T	6	6	5211	5216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014555	CATT	2	8	5276	5283	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_014555	ATT	2	6	5298	5303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014555	A	6	6	5508	5513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014555	C	6	6	5528	5533	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
101	NC_014555	A	6	6	5550	5555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014555	GTT	2	6	5600	5605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014555	TAA	2	6	5669	5674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014555	TTA	2	6	5727	5732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014555	GTG	2	6	5796	5801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014555	GTGC	2	8	5856	5863	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_014555	TCT	2	6	5940	5945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014555	C	6	6	5962	5967	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
109	NC_014555	ATG	2	6	6016	6021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014555	AGT	2	6	6025	6030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014555	T	6	6	6065	6070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014555	GCTTGC	2	12	6099	6110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_014555	CAG	2	6	6145	6150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_014555	TTGCT	2	10	6186	6195	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_014555	GTT	2	6	6197	6202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014555	AC	3	6	6284	6289	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_014555	GC	3	6	6316	6321	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_014555	CTT	2	6	6391	6396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_014555	TAG	6	18	6418	6435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014555	GTT	2	6	6465	6470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014555	GTCGT	2	10	6492	6501	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_014555	TTG	2	6	6530	6535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014555	CGT	2	6	6550	6555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_014555	CTGG	2	8	6646	6653	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_014555	TTG	2	6	6671	6676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014555	CCG	2	6	6733	6738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_014555	GCA	2	6	6828	6833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_014555	GCT	2	6	6848	6853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_014555	CGTT	2	8	6856	6863	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_014555	CG	3	6	6866	6871	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_014555	A	6	6	6995	7000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014555	AGC	2	6	7028	7033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_014555	GA	6	12	7034	7045	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014555	T	7	7	7055	7061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014555	T	15	15	7147	7161	0 %	100 %	0 %	0 %	308182195
136	NC_014555	T	6	6	7192	7197	0 %	100 %	0 %	0 %	308182195
137	NC_014555	GTTT	2	8	7202	7209	0 %	75 %	25 %	0 %	308182195
138	NC_014555	GGT	2	6	7211	7216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308182195
139	NC_014555	TTTTA	2	10	7235	7244	20 %	80 %	0 %	0 %	308182195
140	NC_014555	T	6	6	7283	7288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014555	C	6	6	7331	7336	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
142	NC_014555	AAG	2	6	7337	7342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014555	CAT	2	6	7385	7390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182196
144	NC_014555	GCC	2	6	7391	7396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308182196
145	NC_014555	TCT	2	6	7452	7457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182196
146	NC_014555	GAAACC	2	12	7500	7511	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	308182196
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148	NC_014555	CTT	2	6	7558	7563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182196
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150	NC_014555	CAT	2	6	7648	7653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182196
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283	NC_014555	TG	3	6	13651	13656	0 %	50 %	50 %	0 %	308182201
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400	NC_014555	GA	3	6	19333	19338	50 %	0 %	50 %	0 %	308182206
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405	NC_014555	CATCA	2	10	19773	19782	40 %	20 %	0 %	40 %	308182206
406	NC_014555	ATG	2	6	19795	19800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182206
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411	NC_014555	GGC	2	6	20100	20105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308182206
412	NC_014555	AAC	2	6	20214	20219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308182206
413	NC_014555	CAA	2	6	20262	20267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308182206
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463	NC_014555	T	7	7	22709	22715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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